С 1998 года российские исследователи  получили возможность использовать программные пакеты GCG и WhatIf.

GCG (синоним - Wisconsin Package) представляет собой один из наиболее популярных пакетов программ для анализа биологических последовательностей (т.е. первичных структур ДНК, РНК и белков).
Пакет содержит средства, позволяющие:

• находить нужные последовательности в базах данных (SwissProt, EMBL) по названиям, ключевым словам или гомологиям;
• переводить последовательности, заданные пользователем, в формат GCG для дальнейшей работы;
• производить парное или множественное выравнивание;
• находить в белковой последовательности паттерны, представленные в банке ProSite;
• строить филогенетические деревья;
• предсказывать вторичную структуру РНК и белков;
• сшивать фрагменты

WhatIf  - это пакет, предназначенный для моделирования трехмерных структур белков. WhatIf позволяет:

• Выводить на экран визуализацию данных о пространственной структуре макромолекулы, содержащихся в PDB-файле. Компьютерную модель молекулы можно рассматривать по частям, в разных ракурсах и увеличениях, в различных условных раскрасках.
• Экспериментировать с компьютерными моделями макромолекул. Например, можно заменить один или несколько аминокислотных остатков белка на другие и получить грубое предсказание того, как должна от этого измениться укладка цепи.
• Быстро и удобно получать данные о контактах остатков, водородных связях, степени экспонированности остатков на поверхность макромолекулы, значениях торсионных углов и т.п.

Желающие пользоваться предлагаемым сервисом должны прислать заявку (по почте, факсу или e-mail, отдельная заявка на каждую лицензию).Наш почтовый адрес:

   119899, Москва, Воробьевы горы, МГУ
   Лабораторный корпус "А",
   НИИ физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского,
   комн. 234, Никитиной Елене Петровне

Факс:  (095) 939-31-81
E-mail:  [email protected]
Телефон для справок:  (095)932-8825

Образец заявки:

Директору Института физико-химической биологии
им. А.Н.Белозерского МГУ
академику Скулачеву В.П.
от научного сотрудника НИИАБВ РАН
Иванова Ивана Ивановича

Web-страницы: GCG      WhatIf